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低温显微镜揭示生命起源与纳米尺寸复制机有关 | {$randkws}热点解读 活性位点用黄/红光突出显示

低温显微镜揭示生命起源与纳米尺寸复制机有关
图为一种被觉得与生命起源有关的RNA聚合酶核酶。核酶被冷冻在冰中,象征着它是如何被及时冷冻以开展成像的,以及它如何在冰冷的条件下发挥最佳作用。活性位点用黄/红光突出显示,模板-产物螺旋的福州网友热议彩蛋解析提议位置以透明方式显示。功劳:uux.cn/符文·基德莫斯
(神秘的地球uux.cn)据奥胡斯大学(Lise Refstrup Linnebjerg Pedersen):繁琐的生命分子机制是如何从简易的开端进展起来的,这是一个持久存在的难题。几条证据指向一个原始的“RNA全球”,在那里,“RNA复制机”(所谓的复制酶)着手复制自身和其他RNA分子,以开启进化和生命本身。但是,古老的复制酶似乎已然消失了,它在现代生物学中的快速折叠屏一览作用已然被更高效的蛋白质机器取代。
以便扶持RNA全球假说,探究人员一直在寻求在评测室中再造一种等同于RNA复制酶的酶。尽管这种古老复制酶的分子“分身”已然被察觉,但由于难以确定动向RNA分子的结构,它们的详尽分子结构和作用模式依然难以捉摸。
嗜冰RNA复制酶的结构
在《美国全国科学院院刊》上发表的一篇探究论文中,一组探究人员如今运用低温电子显微镜(cryo-EM)报表了RNA复制酶的昨天最适合读的一句话:岁月可期第一个原子结构。
正探究的RNA复制酶是由霍利格评测室(英国剑桥LMB MRC)开发的,可以在共晶冰相(相似于冰凌)中使用核苷酸三联体有效复制长模板。
现任奥胡斯大学助理教授的Emil L. Kristoffersen从霍利格评测室的博士后探究回来后,合作了与安德森评测室(丹麦奥胡斯大学)的兴办,经由冷冻电镜确定了RNA复制酶的结构。有趣的是,这种结构与基于蛋白质的最新张颂文报道聚合酶有惊人的相似之处,其模板结合、聚合和底物确认的结构域以相似张开的手的分子形状排列。
“令人惊讶的是,我们在试管中人工进化的核酶显示出天然蛋白质聚合酶的特征。这表明不管材料是RNA还是蛋白质,进化都可以察觉聚合的分子解决计划,”英国剑桥LMB医学探究中心项目负责人菲利普·霍利格阐释道
RNA全球中的RNA合成模型
以便更好地知晓RNA复制酶的岗位原理,探究人员开展了完整的突变探究,以突出RNA结构的核心元素。这项确认证实了催化位点的特征,但也揭示了两种所谓的接吻环相互作用的重大性,这种相互作用将支架和催化亚单位结合在一起,以及特定RNA结构域对保真度的重大性,即复制酶复制RNA链的精确性。
尽管探究人员无法确定在主动复制RNA时复制酶的结构,但有或许兴办一个与所有评测资料一致的基于RNA的RNA复制模型。
“Cryo-EM是探究RNA分子结构和动力学特征的一种强有力的方法。尤恩·麦克雷说:“经由结合冷冻电镜资料和评测,我们能够兴办这种繁琐RNA机器内部管理的模型。”他在奥胡斯大学安德森评测室做博士后探究,但如今已然在美国德克萨斯州休斯顿卫理公会探究所兴办了自己的探究小组..
RNA纳米技术和医学的启示
这项探究令人兴奋地首次目睹了被觉得位于生命之树根部的RNA复制酶。但是,当下开发的基于RNA的复制酶相当低效(与基于蛋白质的聚合酶相比),并且还不能维持自身的复制和进化。报导的探究提供的结构洞察力或许有助于设计更有效的复制机制,从而使我们更接近于在试管中开发RNA全球场景。
“RNA复制酶的特性可以经由使用RNA全球中或许存在的化学修饰来进一步改进。另外,对生命起源的探究导致察觉了几种新的RNA兴办模块,这些模块或许用于新兴的RNA纳米技术和医学领域,”丹麦奥胡斯大学副教授Ebbe Sloth Andersen阐释说。

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